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1.10: Filas y columnas - Biología

1.10: Filas y columnas - Biología


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Volvamos a la salida de las proteínas de levadura frente a las proteínas de levadura self-BLAST que realizamos anteriormente, del archivo levadura_blastp_yeast_top2.txt.

Preguntémonos lo siguiente: ¿cuántas secuencias de este conjunto de datos coincidían con alguna otra secuencia? Para empezar, probablemente usemos ungrep -v '#'para eliminar todas las líneas de comentarios, pero ¿luego qué? Podríamos intentar usarWCpara contar las líneas, pero solo después de eliminar también los autoataques, donde el ID en la primera columna es igual al ID en la segunda columna. Ninguna de las utilidades que hemos visto hasta ahoragrep,clasificar,cabeza, ocola—Puede realizar esta tarea. Necesitamos una nueva herramientaawk, que es una herramienta de procesamiento línea por línea y columna por columna para archivos de texto:awk '' o... | awk ''.

Escrita a finales de la década de 1970 y con el nombre de sus autores (Alfred Aho, Peter Weinberger y Brian Kernigan),awkproporciona un lenguaje de programación sofisticado que facilita el análisis de datos tabulares como los resultados de BLAST anteriores. La sintaxis deawkpuede ser bastante complejo, pero gran parte de la complejidad se puede ignorar en el uso regular.

Primero, respondamos nuestra pregunta específica, de cuántas secuencias tienen coincidencias con otras secuencias, y luego veremos algunasawksintaxis más en general. losawkcomando que queremos, imprimiendo solo aquellas líneas donde las dos primeras columnas no son iguales, esawk '{if ($ 1! = $ 2) {print $ 0}}'.

Rompiendo elawkcomando, el "programa" que se ejecuta está delimitado por las comillas simples (que cotejan su contenido en un solo parámetro de línea de comando que se envía alawkprograma). El código dentro del par exterior de llaves se ejecuta para cada línea. Para cada línea, si el contenido de la primera columna (representada por$1) no son iguales a (!=) la segunda columna ($2), se ejecuta el código del siguiente par de llaves y la línea ($0) se imprime (en salida estándar).

En teoría, en este punto deberíamos poder reemplazar elmenos -Scon unWCcontar las líneas, y así contar el número de secuencias que tenían coincidencias con otras secuencias. Desafortunadamente, en este caso, la teoría no se alinea con la realidad: inspeccionar la salida anterior revela que IDYDR545Wtodavía está representado por dos líneas, por lo que esta secuencia se contabilizaría dos veces.

¿Por qué? En el comando BLAST, solicitamos los dos HSP superiores por consulta con-max_target_seqs 2y-max_hsps 1, por lo que esperábamos que el mejor HSP sería para la secuencia en sí, y el segundo mejor (si existía) sería para un no auto-golpe. Pero en este caso,blastxdecidió informar de dos no auto-golpes. De hecho, si tuviéramos que inspeccionarYDR545W,YOR396W, yYLR467W, encontraríamos que sus secuencias son idénticas, por lo que BLAST necesitaba elegir dos HSP del empate de tres vías.

Para obtener el número correcto de secuencias que coinciden con otras, debemos eliminar cualquier duplicado que aún se pueda encontrar en la primera columna. Podemos hacer esto agregando unordenar -k1,1d -u, para una respuesta final de 2,884.

Para cualquier conjunto de datos suficientemente complejo, es una buena idea verificar tantas suposiciones como sea posible al realizar un análisis. En lo anterior, usandoWCen las líneas para contar el número de secuencias que tuvieron accesos a otras, implicaba que en la primera columna no figuraba ningún ID dos veces. En este caso, comparar los recuentos con y sin elordenar -k1,1d -userviría para verificar o rechazar este supuesto. En capítulos posteriores, aprenderemos más técnicas para este tipo de "verificación de cordura".

Sintaxis básica para awk

A pesar de queawkse puede utilizar como un lenguaje de programación con todas las funciones (completo con bucles, matrices, etc.), para necesidades de programación sofisticadas, otros lenguajes como Python y R suelen ser más adecuados. Echemos un vistazo a un subconjunto práctico de su sintaxis.

Declaraciones en elEMPEZAREl bloque se ejecuta antes de que se procese cualquier línea de la entrada, las sentencias en el bloque medio sin adornos se ejecutan para cada línea y las sentencias en elFINbloque se ejecutan después de que se procesa la última línea. Cada uno de estos bloques es opcional, aunque el bloque del medio "para cada línea" rara vez se omite en la práctica.

Al procesar una línea, hay varias variables disponibles para su uso. Aunque muchos de ellos comienzan con un$, no son variables de entorno (debido a que hemos colocado el "programa" entre comillas simples, se envían aawkcomo cuerdas inalteradas,$signos intactos).

  • $0
    • Mantiene el contenido de toda la línea que se está procesando.
  • $1,$2etc.
    • $1contiene el contenido de la primera columna de la línea actual,$2contiene el contenido de la segunda columna de la línea actual, y así sucesivamente. Igual queclasificar,awkde forma predeterminada, se asume que las columnas están separadas por espacios en blanco.
  • NF
    • La variable especialNFcontiene el número de columnas (también conocidas como campos) en la línea actual (awkno requiere que todas las líneas contengan el mismo número de columnas).
  • NR
    • NRcontiene el número de líneas que se han procesado hasta el momento, incluida la línea actual. Así en elEMPEZARlínea,NRsostiene0; durante el procesamiento de la primera línea,NRsostiene 1; y en elFINcuadra,NRcontiene el número total de líneas en la entrada.

Tenga en cuenta que tanto elNFyNRfalta un$prefijo. El texto colocado en los tres bloques puede constar de una amplia variedad de cosas, incluidos condicionales, declaraciones impresas, manipulaciones lógicas y matemáticas, etc. Quizás una colección de ejemplos ayude a ilustrar la utilidad deawk. Todos estos ejemplos se basan en la salida BLAST anterior, después de filtrar las líneas de comentarios congrep -v '#'.

Este comando imprime solo las dos primeras columnas de la tabla, separadas por un espacio (el valor predeterminado cuando se incluye una coma en unimpresióndeclaración):

En lugar de separar las dos columnas de salida por un espacio, podemos separarlas por una cadena como:::, produciendo solo una columna de salida conglomerada.

Si deseamos agregar una nueva primera columna que simplemente contenga el número de línea, podemos usar elNRvariable junto con la$0variable:

Si las declaraciones permitenawkejecutar otras declaraciones condicionalmente; la sintaxis esif () {}. Además, si una columna contiene valores numéricos,awkpuede trabajar con ellos como tales, yawkincluso comprende la notación científica. A continuación, se muestra un ejemplo en el que solo las líneas con HSP mi valores (la décima columna en nuestro ejemplo) de menos de1e-10están impresos.

Observe que la organización de las llaves produce una estructura de bloques anidados; aunque en este caso simple se podría omitir el conjunto de corchetes internos, generalmente es una buena práctica incluirlos, ya que ilustran exactamente qué declaración está controlada por la anterior.si.[1]

Las sentencias if pueden controlar múltiples condiciones y, a veces, ayuda a romperawkprogramas en varias líneas para ayudar con su legibilidad, especialmente cuando están incluidos en scripts ejecutables. Esta sofisticada declaración agrega una nueva primera columna que categoriza cada PAS como "excelente", "bueno" u "aceptable", según el mi valor, imprimiendo solo los dos ID y el mi valor (columnas 1, 2 y 10):

Es bastante fácil determinar si una columna en particular es igual a una cadena dada, por ejemplo, para extraer todas las líneas donde está la primera columna.YAL054C:

Los cálculos matemáticos son una buena característica deawk. Por ejemplo, las columnas 4 y 5 contienen la longitud total de la secuencia de la consulta y la secuencia del tema, respectivamente, por lo que es posible que deseemos imprimir la proporción de estos dos como una columna adicional al final.

A continuación, podríamos canalizar el resultado a unsort -k3,3g | cola -n 5para ver las cinco PAS con las mayores proporciones. Sin embargo, tenga en cuenta que al realizar operaciones matemáticas o comparaciones con columnas, cualquier contenido que no se pueda analizar como un número (1.5puede ser, como puede2y4e-4, pero noi5oN / A) puede estar truncado (p. ej.,10x1es tratado como justo10) o tratado como0. Utilizandoclasificaren columnas con-gramopuede revelar tales problemas potenciales, ya que se utiliza el mismo método subyacente para el análisis.

Hay una variedad de funciones matemáticas integradas enawk. Aquí tienes una muestra:

  • Iniciar sesión()
    • Devuelve el logaritmo natural de su argumento, como enimprimir $ 10 * registro ($ 3 * $ 4)para imprimir el registro de la multiplicación de la tercera y cuarta columna por la décima columna.[2]
  • largo()
    • loslargo()La función devuelve el número de caracteres en su argumento, como enlongitud ($ 1)para la longitud de caracteres de la primera columna, ylongitud ($ 0)para la longitud de caracteres de toda la línea (espacios y tabulaciones incluidos).
  • **
    • Este operador devuelve el lado izquierdo elevado a la potencia del lado derecho, como en$1**2para el cuadrado de la primera columna.
  • %
    • El operador de módulo, devolviendo el resto después de dividir el lado izquierdo por el lado derecho. Por ejemplo,NR% 4será 1 en la primera línea, 2 en la segunda, 3 en la tercera, 0 en la cuarta, 1 en la quinta, y así sucesivamente.
  • Exp()
    • Esta función devuelve su argumento elevado a la potencia natural. mi. Por ejemplo,log (exp ($ 1))devuelve el valor de la primera columna.
  • En t()
    • Devuelve la parte entera de su argumento. Por ejemplo,int (6,8)devoluciones6, yint (-3,6)devoluciones-3.
  • rand ()
    • Cuando no se proporcionan argumentos, devuelve un número aleatorio entre 0 (inclusive) y 1 (exclusivo). Por defecto, cada vezawkse ejecuta, la serie de números aleatorios producidos por múltiples llamadas arand ()es el mismo. Para obtener una serie aleatoria "aleatoria", ejecutesrand ()(que "siembra" el generador de números aleatorios) en elEMPEZARbloquear, como enCOMIENZO {srand ()} {print rand (), $ 0}.

Las expresiones lógicas se pueden combinar con operadores booleanos, incluidos&&para "y" y||para "o" (que produce verdadero si uno o ambos lados son verdaderos), y la agrupación se puede lograr entre paréntesis. Por ejemplo, es posible que deseemos imprimir solo aquellas líneas donde la primera columna no es igual a la segunda, y la décima columna es menor que1e-30o la segunda columna esYAL044C.

Hasta ahora, no hemos hecho mucho uso de laEMPEZARoFINbloques, que son especialmente útiles cuando definimos y actualizamos nuestras propias variables. Podemos lograr esta tarea con un=asignación (no confundir con la==comparación). Este comando imprime el promedio mi valores en nuestro archivo de resultado BLAST de ejemplo.

Este comando funciona porque el lado derecho de una asignación a una variable con=se evalúa antes de que ocurra la asignación. Así, en elEMPEZARbloque, elsumevalla variable se inicializa a0, luego para cada línea el valor desumevalse agrega al contenido de la décima columna (el mi valor de esa línea), y el resultado se almacena ensumeval. Finalmente, en elFINcuadra,sumevalcontiene la suma total de mi valores, y podemos dividir este resultado por el número de líneas procesadas,NR.

Podemos ejecutar varias sentencias dentro de un solo bloque si las separamos con punto y coma. En el ejemplo anterior, el promedio mi el valor calculado incluye los auto-golpes. Podemos filtrarlos con una declaración if antes de modificarsumeval, pero no queremos dividir el resultado entreNR, porque eso también incluirá los recuentos de auto-golpes. Para resolver este problema, necesitaremos mantener dos variables.

Como antes, algunos ID todavía están presentes más de una vez en la primera columna con esta solución, por lo que puede tener más sentido filtrar primero las líneas deseadas usando elawkyordenar -k1,1d -usolución de arriba, y luego use otraawkpara el cálculo promedio.

Ejercicios

  1. En el archivo pz_blastx_yeast_top10.txt, ¿cuántas HSP (líneas) tienen un mi valor que es menor que1e-30o ¿Tiene un valor de identidad superior al 50%? Usarawk,WC, ygrepsi es necesario para calcular la respuesta.
  2. El archivo contig_stats.txt describe estadísticas para contigs de un ensamblaje de novo del genoma (un contig es una "pieza" ensamblada del genoma). La cuarta columna describe el contenido de GC de los distintos contigs. Otros análisis indican que la mayoría de genes ensamblados correctamente tienen una cobertura media (segunda columna) de entre 80,0 y 150,0. Usarawkpara determinar el contenido de GC promedio para contigs con cobertura entre 80.0 y 150.0. Luego usa otra invocación deawkpara determinar el contenido de GC promedio para todos los demás contigs. (No cuente la línea de encabezado en el archivo en sus cálculos).
  3. El archivo PZ.annot.txt es el resultado de un análisis de ontología genética (GO) para el conjunto completo de Papilio zelicaon Secuencias de ADNc. Debido a la naturaleza incompleta del proceso de anotación, no se asignaron términos GO a todas las secuencias. ¿Cuántos ID de secuencia diferentes están representados en este archivo?
  4. Algunas versiones delclasificarEl programa puede ordenar las líneas en orden "aleatorio" utilizando el-Rbandera. Sin embargo, en lugar de usar esta bandera, usegrep,awk(con elrand ()característica)clasificar(sin el-Rbandera) ycabezapara seleccionar cinco ID aleatorios de pz_cDNAs.fasta. Un resultado de ejemplo podría verse así:
    El mismo comando debería producir una lista diferente de cinco ID cada vez que se ejecuta.


La forma estándar de hablar sobre cualquier celda específica en una hoja de trabajo es explicar su columna y fila, ya que esa es la única forma en que se organizan las celdas.

Por ejemplo, para hacer referencia a una celda en la Columna G que está en la Fila 15, debe especificar G15. La columna siempre va primero seguida de la fila, sin espacio.

Esta convención de nomenclatura es cierta no solo de boca en boca y por escrito, sino también al hacer fórmulas en una hoja de cálculo. Por ejemplo, usando = suma (F1: F5) en Google Sheets explica al programa de hoja de cálculo cómo calcular la suma de F1 a F5.


Las tablas se pueden dividir en tres porciones y menos un encabezado, un cuerpo y un pie. El encabezado y el pie son bastante similares a los encabezados y pies de página en un documento de procesamiento de texto que siguen siendo los mismos para cada página, mientras que el cuerpo es el principal contenedor de contenido de la tabla.

Los tres elementos para separar la cabeza, el cuerpo y el pie de una mesa son & menos

& ltthead & gt & menos para crear un encabezado de tabla independiente.

& lttbody & gt & menos para indicar el cuerpo principal de la tabla.

& lttfoot & gt & menos para crear un pie de tabla separado.

Una tabla puede contener varios elementos & lttbody & gt para indicar diferentes paginas o grupos de datos. Pero es notable que las etiquetas & ltthead & gt y & lttfoot & gt deberían aparecer antes de & lttbody & gt

Ejemplo

Esto producirá el siguiente resultado y menos


Como una lista

Los marcos de datos son esencialmente listas, es decir, son una lista de vectores de columna (que todos deben tener la misma longitud). Las listas pueden ser subconjuntos usando corchetes simples [para una sublista, o corchetes dobles [[para un solo elemento.

Con datos de corchetes simples [columnas]

Cuando usa corchetes simples y sin comas, obtendrá la columna porque los marcos de datos son listas de columnas.

Soportes individuales como una lista vs paréntesis simples como una matriz

La diferencia entre datos [columnas] y datos [, columnas] es que cuando se trata el marco de datos como una lista (sin comas entre corchetes), el objeto devuelto ser un marco de datos . Si usa una coma para tratar el data.frame como una matriz, al seleccionar una sola columna se devolverá un vector, pero al seleccionar varias columnas se devolverá un data.frame.

Con datos entre corchetes dobles [[one_column]]

Para extraer una sola columna como vector al tratar su data.frame como una lista, puede usar corchetes dobles [[. Esto solo funcionará para una sola columna a la vez.


Cómo agrupar en Excel para visualizar datos anidados

Excel le permite crear un esquema que consta de hasta ocho niveles. Es una herramienta de uso frecuente cuando necesita resumir una larga lista de datos como un grupo de encabezados individuales. El contorno más a la izquierda o exterior comienza con el Número 1 (uno)y, a medida que avanza hacia la derecha, puede subir hasta Número 8 (ocho).

Puede visualizar rápidamente datos anidados como un grupo o datos de resumen o incluso revelar los detalles de cada grupo utilizando las filas de grupo de Excel o la herramienta de esquema. Excel le permite crear el Esquema de columnas, el Esquema de filas, y el Esquema de filas y columnas.

Grupo automático de Excel para crear un esquema

Cuando necesite organizar listas de datos anidadas más pequeñas, puede utilizar la herramienta Esquema para crear grupos automáticos. Puedes probar estos pasos:

  1. Haga clic en cualquier celda dentro de los datos de la fila que necesita agrupar.
  2. Ahora, ve al Datos pestaña en el Excel Cinta.
  3. Dentro de Esquema sección, encontrarás Grupo Menú desplegable.
  4. Haga clic en Grupo y luego seleccione Esquema automático.

Notarás que la función de grupo organizó las filas perfectamente. También verá el Esquema barras en el lado izquierdo que representan múltiples estructuras de nivel de datos.

Puede explorar múltiples opciones de visualización interactuando con el Niveles botón como Número 1 (Uno), Número 2 (Dos), Número 3 (Tres), etc.

1. Si selecciona el nivel más bajo, Número 1 (uno), verá datos mínimos en la hoja de trabajo. En el ejemplo actual, es el Gran total costo de todos los alimentos.

2. Cuando hagas clic en el siguiente nivel, solo verás el Total parcial filas junto con el Gran total hilera. No verá otras listas de datos detalladas en la hoja de cálculo de Excel.

3. Ahora puede seleccionar el nivel más alto o Número 3 (tres) en los datos de ejemplo actuales para expandir todas las filas y columnas junto con la vista delineada.

También puede utilizar los pasos anteriores para agrupar columnas en Excel. Formatee los conjuntos de datos en consecuencia para que Excel Esquema El comando puede reconocer los subtotales.

Comando de grupo de Excel para agrupar filas manualmente

Cuando la hoja de trabajo contiene conjuntos de datos complejos como más de un nivel de información, debe usar la Grupo comando para la agrupación manual.

  1. Seleccione un subconjunto de datos que desee incluir en un grupo y luego haga clic en el Grupo comando en el Datos pestaña de Excel Cinta.
  2. Para crear otro grupo con otro subconjunto de datos, seleccionar las filas y luego haga clic en el comando Grupo o use esta tecla de acceso directo Mayús + Alt + Flecha derecha.

3. Si desea crear un grupo anidado, elija todas las filas de detalles dentro de la fila de resumen relacionada y luego use el acceso directo Mayús + Alt + Flecha derecha.

Puede ocultar filas detalladas utilizando la opción de contraer filas de Excel: el Menos (-) Firme en los esquemas para simplificar los datos anidados complejos. Cuando contrae una barra de contorno, la Menos (-) firmar cambios en el Más (+) firmar para mostrar filas más tarde.

Además, puede utilizar el Mostrar detalle y Ocultar detalle botones en el Esquema sección de la Datos pestaña en Excel Cinta.

Hay estilos incorporados para grupos y esquemas dentro de la hoja de cálculo de Excel. Aplicar Estilos, haga clic en el icono del iniciador del cuadro de diálogo (una pequeña flecha desplegable) en el Contornos sección de la Datos pestaña.

Verás un Ajustes caja de diálogo. Haga clic en la casilla de verificación para Estilos automáticos y luego haga clic en el Aplicar estilos botón.


Como acaba de ver, congelar paneles en Excel es una de las tareas más fáciles de realizar. Sin embargo, como suele ser el caso de Microsoft, hay mucho más bajo el capó. Lo que sigue a continuación es una advertencia, un artefacto y un consejo.

Advertencia: evite filas / columnas ocultas al congelar paneles de Excel

Cuando bloquea varias filas o columnas en una hoja de cálculo, es posible que oculte algunas de ellas sin darse cuenta y, como resultado, no verá esos paneles ocultos más adelante. Para evitar esto, asegúrese de que todas las filas y / o columnas que desea bloquear estén a la vista en el momento de la congelación.

Por ejemplo, desea congelar las primeras tres filas, pero la fila 1 está actualmente fuera de vista, como se muestra en la captura de pantalla a continuación. Como resultado, la fila 1 no aparecerá más tarde y no podrá desplazarse hacia arriba. Sin embargo, aún podrá llegar a las celdas en una fila congelada oculta usando las teclas de flecha.

Artefacto: Excel puede congelar paneles totalmente diferentes de lo que esperaba

¿No me crees? Luego intente seleccionar la celda A1, o la fila superior visible, o la columna visible más a la izquierda, haga clic en Congelar paneles y mira lo que pasa.

Por ejemplo, si selecciona la fila 4 mientras las primeras 3 filas están fuera de la vista (no ocultas, justo encima del desplazamiento) y haga clic en Congelar paneles, que esperabas Lo más obvio es que las filas 1 a 3 se congelarían. ¡No! Microsoft Excel piensa de manera diferente y la captura de pantalla a continuación muestra uno de los muchos resultados posibles:

Por lo tanto, recuerde que los paneles que va a bloquear, tanto filas como columnas, siempre deben estar a la vista.

Consejo: Cómo camuflar la línea Freeze Panes

Si no le gusta especialmente la línea oscura de los paneles congelados que Microsoft Excel dibuja debajo de las filas bloqueadas y a la derecha de las columnas bloqueadas, puede intentar disfrazarla con la ayuda de formas y un poco de creatividad :)

Si cree que esto es algo que podría funcionar para usted, consulte el siguiente artículo para obtener instrucciones paso a paso: Manejo de la línea de paneles congelados de Excel.


Filas y columnas n. ° 038

Las filas y columnas son similares a las tablas HTML. Se puede colocar una fila en la parte superior, media o inferior del módulo. Y luego puede elegir cuántas columnas debe tener cada fila. Luego, de manera similar a los grupos de capas, sus capas se pueden agregar a las columnas.

Ajuste automático de la altura del módulo

Cuando el texto se coloca dentro de Filas y Columnas, el Módulo siempre ajustará su altura dinámicamente para asegurarse de que todo el contenido esté siempre visible. & ampnbspEsto es especialmente útil para los módulos & # 8217 que contienen grandes cantidades de texto.

Para agregar un grupo de capas, selecciónelo en el menú principal de capas

Vista del dispositivo en la que las columnas deben colapsar.

1. Columnas preestablecidas
Seleccione un ajuste preestablecido de fórmula de columnas.

2. Fórmula de columnas
O ingrese cómo deben configurarse sus columnas manualmente (las fracciones siempre deben sumar el número 1).

3. Romper en
Elija qué ventana gráfica de dispositivo deben colapsar las columnas en una sola columna.

4. Posición de la fila
Elija si la Fila debe estar alineada con la parte superior, media o inferior del Módulo (similar a HTML valign).

1. Alineación vertical
Elija si el contenido de la columna & # 8217s debe alinearse con la parte superior, media o inferior de la columna (similar a HTML valign).

2. Alineación de texto
Establezca cómo se debe alinear el texto dentro de la columna.

Y luego establezca un Fondo opcional para la Columna, y ajuste el margen y los rellenos de la Columna & # 8217s.

Filas y columnas n. ° 038

El autor

La fuerza no proviene de ganar. Tus luchas desarrollan tus fortalezas. Cuando atraviesas dificultades y decides no rendirte, eso es fuerza.


Tendencias de la tabla periódica

ThoughtCo / Maritsa Patrinos

La tabla periódica está organizada para mostrar las diferentes tendencias (periodicidad).

  • Radio atómico (la mitad de la distancia entre el centro de dos átomos que se tocan entre sí)
    • aumenta moviéndose de arriba hacia abajo hacia abajo en la mesa
    • disminuye moviéndose de izquierda a derecha a través de la mesa
    • disminuye moviéndose de arriba a abajo
    • aumenta moviéndose de izquierda a derecha
    • disminuye moviéndose de arriba hacia abajo
    • aumenta moviéndose de izquierda a derecha

    Pegar0

    La función paste () en R es una buena forma de concatenar conjuntos de valores. Digamos & # 8217s que necesita inventar algunos datos de expresión genética falsos para ilustrar un mapa de calor.

    # use rnorm () para generar 100 valores aleatorios para llenar una matriz
    gdat & lt- matriz (rnorm (100), nrow = 10, ncol = 10)

    Usamos la función rnorm () para tomar 100 valores aleatorios de una distribución Normal y colocarlos en una matriz. Si se supone que esta matriz representa valores de expresión génica, normalmente las filas representan genes y las columnas representan muestras o condiciones. Podemos usar la función paste () para crear nombres para las filas y columnas.

    # crea 10 nombres de genes falsos para etiquetar las filas
    nombres de fila (gdat) & lt- pegar (& quotg & quot, 1:10, sep = & quot & quot)
    # crea 10 nombres de muestra falsos para etiquetar las columnas
    colnames (gdat) & lt- paste (& quots & quot, 1:10, sep = & quot & quot)

    # ahora podemos dibujar un mapa de calor que tendrá etiquetas de fila y columna
    mapa de calor (gdat)

    La función pegar toma una serie de argumentos para concatenar, así como un separador para cada evento de concatenación. Esto es bueno para muchas cosas, como crear nombres de archivos a partir de otros valores:

    mutantes & lt- c (& quotsir1 & quot, & quotcen3 & quot, & quotrad51 & quot)
    archivos de datos & lt- paste (mutantes, & quottxt & quot, sep = & quot. & quot)

    O para crear dinámicamente una etiqueta de trazado:

    paste ("número de genes detectados:", NumberOfGenes)

    El separador predeterminado para paste () es un carácter de espacio. Entonces, en el ejemplo anterior, omití el argumento & quotsep & quot porque se insertará un carácter de espacio de forma predeterminada. Mientras que en el primer ejemplo con el mapa de calor no quería que aparecieran espacios en mi gen falso y en los nombres de muestra, especifiqué: sep = & quot & quot para anular el valor predeterminado.

    Una vez que comience a usar paste (), lo usará mucho, y la mayoría de las veces diría que desea concatenar cosas sin un espacio, o cualquier otro carácter. Así que a menudo me encuentro escribiendo: paste (a, b, sep = & quot & quot). Un atajo para esto es una función llamada paste0 ()! ¡La función paste0 () es pegar sin separador predeterminado! Siempre lo olvido, pero si puede recordarlo, le ahorrará un poco de escritura y hará que su código sea más legible.

    # crear 10 genes falsos y nombres de muestras
    paste0 ("g", 1:10)
    paste0 ("s", 1:10)


    Haga que sus fórmulas se incrementen por filas al copiar entre columnas

    El incremento automático de referencias de celda de Excel funciona bien la mayor parte del tiempo, pero a veces es posible que desee anular cómo funciona.

    Es posible que desee hacer referencia a una sola celda, como la celda A1, y luego copiar esta referencia en las columnas de la derecha. Naturalmente, esto da como resultado que la referencia de la fórmula cambie a = B1, = C1, = D1, etc., que no es el resultado que desea. Desea que la fórmula se incremente por filas en lugar de columnas, es decir, = A1, = A2, = A3, etc.

    Desafortunadamente, no hay ninguna opción en Excel que le permita hacer esto. Sin embargo, puede evitar esto utilizando la función INDIRECTA con la función DIRECCIÓN anidada en su interior.

    Quizás la mejor manera de explicar cómo crear la función requerida es usar un ejemplo con resultados predecibles. En las celdas A1: A10, ingrese los números 1 mediante 10 en orden numérico. Seleccione la celda D1 y en esta celda ingrese lo siguiente:

    Tan pronto como ingrese esto, el número 1 debería aparecer en la celda D1. Esto se debe a que la fórmula hace referencia a la celda A1.

    Si copia esta fórmula en la columna de la derecha, la celda E1 contendrá el número 2. En otras palabras, aunque está copiando entre columnas, la referencia de la fórmula se incrementa en filas, como se muestra en la figura.

    Este método es especialmente útil cuando una hoja de cálculo tiene encabezados que van hacia abajo en las filas de una columna y desea crear una referencia dinámica a estos encabezados de fila en otras columnas.

    Figura. El resultado de copiar la celda D1 a la celda E1

    Si sigue copiando esto a la derecha, la celda F1 contendrá el número 3, la celda G1 contendrá el número 4, etc. Este es un proceso bastante sencillo si hace referencia a una sola celda. Muchas veces, sin embargo, necesitará hacer referencia a un rango de celdas que se usa en el argumento de una función.

    Usaremos la siempre popular función SUM para demostrar lo que queremos decir. Suponga que recibe una lista larga de números, y su trabajo es sumar la columna de números en una forma total acumulada, como esta:

    El problema se produce porque los resultados deben ser dinámicos y abarcar 100 columnas en la fila 1 únicamente, no 100 filas en otra columna (como suele ser el caso).

    Naturalmente, podría escribir manualmente estas funciones en cada celda individual, pero esto llevaría mucho tiempo. En su lugar, puede utilizar el mismo principio que utilizó al hacer referencia a una sola celda.

    Llene el rango A1: A100 con los números 1 mediante 100 en orden numérico. Ingresar 1 en la celda A1, seleccione la celda A1, mantenga presionada la tecla Ctrl, haga clic con el botón izquierdo y arrastre hacia abajo 100 filas con el controlador de relleno.

    Seleccione la celda D1 e ingrese esta fórmula:

    Esto le dará un resultado de 3, que es la suma de las celdas A1: A2. Copie esta fórmula en la celda E1 y obtendrá un resultado de 6, que es la suma de las celdas A1: A3. Copie en la celda F1 y obtendrá un resultado de 10, que es la suma de las celdas A1: A4.

    Figura. El resultado de copiar la celda D1 a la celda F1

    La función COLUMNA volátil hizo que la última referencia de celda aumentara en 1 cada vez que la copiaba en una nueva columna. Esto se debe a que la función COLUMNA siempre devuelve el número de columna (no la letra) de la celda que la alberga, a menos que haga referencia a una celda diferente.

    Alternativamente, puede utilizar el Pegado especial. »Transponer función en Excel. Agrega la fórmula = SUMA ($ A $ 1: $ A2) a la celda B1 (tenga en cuenta la referencia de columna absoluta de fila relativa a $ A2) y luego copie esta fórmula en la celda B100. Con B2: B100 seleccionado, copie, seleccione la celda D1 (o cualquier celda que tenga 100 o más columnas a la derecha) y luego seleccione Editar »Pegado especial. »Transponer. Si lo desea, puede eliminar las fórmulas en B2: B100.


    Ver el vídeo: Excel - Ordenar y filtrar datos en Excel. Tutorial en español HD (Noviembre 2022).